BEC ( BOROBUDUR EXTRACT CENTER ) telah menggunakan mesin berteknologi canggih buatan Jerman, yang menggunakan 3 tahapan dalam proses ekstraksi yaitu  Perkolasi, Evaporasi dan Drying.

Perkolasi bertujuan untuk mengambil sari / kandungan bahan aktif dari rempah – rempah dengan menggunakan pelarut yang sesuai sehingga didapat ekstrak cair. Proses ini dilakukan secara berkesinambungan sehingga menjamin kandungan bahan aktifnya optimal. Setelah proses perkolasi maka dilanjutkan dengan proses Evaporasi yang bertujuan untuk menguapkan pelarut dan mengentalkan ekstrak cair menjadi ekstrak kental.

Proses evaporasi ini menggunakan system evaporasi 2 tahap (double stage) sehingga lebih efisien dan prosesnya lebih cepat.Ekstrak kental dari proses evaporasi kemudian dikeringkan di mesin Vacuum Belt Dryer (VDB) sehingga menjadi ekstrak kering.

Ekstrak kering ini nantinya akan diproses menjadi berbagai bentuk sediaan obat tradisional seperti kapsul dan tablet.

Pada tahun 2010, ekstrak kering dan ekstrak kental BEC telah memperoleh sertifikat CPOTB dari BPOM sehingga menjamin kualitas dan higienitas dari produk BEC.

Borobudur Extraction Center telah memproduksi lebih dari 50 jenis ekstrak yang banyak digunakan oleh perusahaan farmasi atau obat tradisional. Ekstrak hasil produksi BEC selain digunakan untuk memenuhi kebutuhan internal dari PT Industri Jamu Borobudur, juga telah dipergunakan oleh perusahaan lain antara lain PT. Tempo Tbk. (Indonesia), Asia Botanicals (Malaysia), Beauty Nation (Malaysia) dan Biotranziit, Ltd (Jerman).